Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ATRQ13535 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ATRQ13535 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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