Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Runx1Q03347 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms