Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sparcl1P70663 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms