Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
GzmbP04187 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
GzmbP04187 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
GzmbP04187 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GzmbP04187 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
GzmbP04187 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
GzmbP04187 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms