Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms