Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tspan9Q8BJU2 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms