Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms