Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RLFQ13129 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RLFQ13129 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RLFQ13129 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RLFQ13129 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RLFQ13129 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RLFQ13129 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RLFQ13129 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RLFQ13129 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RLFQ13129 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RLFQ13129 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLFQ13129 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLFQ13129 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLFQ13129 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLFQ13129 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RLFQ13129 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RLFQ13129 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLFQ13129 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RLFQ13129 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLFQ13129 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLFQ13129 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLFQ13129 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLFQ13129 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLFQ13129 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLFQ13129 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLFQ13129 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLFQ13129 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RLFQ13129 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLFQ13129 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLFQ13129 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLFQ13129 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLFQ13129 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLFQ13129 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLFQ13129 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLFQ13129 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLFQ13129 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLFQ13129 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RLFQ13129 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLFQ13129 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLFQ13129 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLFQ13129 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLFQ13129 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLFQ13129 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RLFQ13129 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RLFQ13129 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RLFQ13129 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RLFQ13129 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLFQ13129 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLFQ13129 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLFQ13129 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLFQ13129 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLFQ13129 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLFQ13129 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLFQ13129 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLFQ13129 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RLFQ13129 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLFQ13129 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLFQ13129 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLFQ13129 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLFQ13129 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RLFQ13129 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLFQ13129 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLFQ13129 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RLFQ13129 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLFQ13129 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLFQ13129 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RLFQ13129 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RLFQ13129 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RLFQ13129 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RLFQ13129 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLFQ13129 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLFQ13129 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLFQ13129 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLFQ13129 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLFQ13129 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLFQ13129 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLFQ13129 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLFQ13129 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RLFQ13129 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RLFQ13129 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RLFQ13129 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms