Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 4833412K13Rik-201ENSMUST00000195509 1479 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
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Hoxb1P17919 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Hoxb1P17919 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Hoxb1P17919 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
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Hoxb1P17919 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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