Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms