Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PFDN4Q9NQP4 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PFDN4Q9NQP4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PFDN4Q9NQP4 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PFDN4Q9NQP4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PFDN4Q9NQP4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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