Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Khdc3Q9CWU5 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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