Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Ddx28Q9CWT6 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
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Ddx28Q9CWT6 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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