Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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TRIM54Q9BYV2 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM54Q9BYV2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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