Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms