Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp20Q8C6M1 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp20Q8C6M1 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp20Q8C6M1 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp20Q8C6M1 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp20Q8C6M1 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Usp20Q8C6M1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Usp20Q8C6M1 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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