Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spire1Q52KF3 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms