Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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GEN1Q17RS7 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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GEN1Q17RS7 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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GEN1Q17RS7 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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GEN1Q17RS7 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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GEN1Q17RS7 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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GEN1Q17RS7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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GEN1Q17RS7 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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GEN1Q17RS7 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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GEN1Q17RS7 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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GEN1Q17RS7 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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GEN1Q17RS7 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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GEN1Q17RS7 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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