Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms