Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CBLN3Q6UW01 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CBLN3Q6UW01 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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