Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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PrkchP23298 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
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PrkchP23298 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PrkchP23298 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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