Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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