Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Hdac5Q9Z2V6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Hdac5Q9Z2V6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Hdac5Q9Z2V6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Hdac5Q9Z2V6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Hdac5Q9Z2V6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Hdac5Q9Z2V6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Hdac5Q9Z2V6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Hdac5Q9Z2V6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Hdac5Q9Z2V6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Hdac5Q9Z2V6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Hdac5Q9Z2V6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Hdac5Q9Z2V6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Hdac5Q9Z2V6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Hdac5Q9Z2V6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Hdac5Q9Z2V6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Hdac5Q9Z2V6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Hdac5Q9Z2V6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Hdac5Q9Z2V6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Hdac5Q9Z2V6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Hdac5Q9Z2V6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Hdac5Q9Z2V6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Hdac5Q9Z2V6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Hdac5Q9Z2V6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Hdac5Q9Z2V6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Hdac5Q9Z2V6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Hdac5Q9Z2V6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Hdac5Q9Z2V6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Hdac5Q9Z2V6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Hdac5Q9Z2V6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hdac5Q9Z2V6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hdac5Q9Z2V6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hdac5Q9Z2V6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Hdac5Q9Z2V6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hdac5Q9Z2V6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hdac5Q9Z2V6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hdac5Q9Z2V6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hdac5Q9Z2V6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hdac5Q9Z2V6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hdac5Q9Z2V6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Hdac5Q9Z2V6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hdac5Q9Z2V6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hdac5Q9Z2V6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hdac5Q9Z2V6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hdac5Q9Z2V6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hdac5Q9Z2V6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hdac5Q9Z2V6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hdac5Q9Z2V6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hdac5Q9Z2V6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms