Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms