Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ror1Q9Z139 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ror1Q9Z139 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ror1Q9Z139 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ror1Q9Z139 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ror1Q9Z139 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ror1Q9Z139 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ror1Q9Z139 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ror1Q9Z139 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ror1Q9Z139 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ror1Q9Z139 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ror1Q9Z139 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ror1Q9Z139 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ror1Q9Z139 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ror1Q9Z139 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ror1Q9Z139 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ror1Q9Z139 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ror1Q9Z139 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ror1Q9Z139 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ror1Q9Z139 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ror1Q9Z139 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ror1Q9Z139 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ror1Q9Z139 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ror1Q9Z139 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ror1Q9Z139 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ror1Q9Z139 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ror1Q9Z139 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ror1Q9Z139 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms