Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NgfrQ9Z0W1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NgfrQ9Z0W1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms