Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVK8

Cyp46a1, Cholesterol 24-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp46a1Q9WVK8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cyp46a1Q9WVK8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyp46a1Q9WVK8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyp46a1Q9WVK8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms