Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prkab1Q9R078 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prkab1Q9R078 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prkab1Q9R078 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Prkab1Q9R078 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prkab1Q9R078 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prkab1Q9R078 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prkab1Q9R078 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prkab1Q9R078 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prkab1Q9R078 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prkab1Q9R078 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prkab1Q9R078 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms