Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nphp1Q9QY53 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nphp1Q9QY53 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nphp1Q9QY53 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nphp1Q9QY53 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nphp1Q9QY53 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nphp1Q9QY53 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nphp1Q9QY53 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Nphp1Q9QY53 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nphp1Q9QY53 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nphp1Q9QY53 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nphp1Q9QY53 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nphp1Q9QY53 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Nphp1Q9QY53 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nphp1Q9QY53 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nphp1Q9QY53 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nphp1Q9QY53 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nphp1Q9QY53 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nphp1Q9QY53 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nphp1Q9QY53 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nphp1Q9QY53 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nphp1Q9QY53 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nphp1Q9QY53 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Nphp1Q9QY53 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nphp1Q9QY53 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nphp1Q9QY53 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nphp1Q9QY53 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nphp1Q9QY53 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nphp1Q9QY53 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nphp1Q9QY53 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nphp1Q9QY53 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nphp1Q9QY53 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nphp1Q9QY53 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nphp1Q9QY53 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms