Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psma6Q9QUM9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psma6Q9QUM9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms