Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk1eQ9JMK2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Csnk1eQ9JMK2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Csnk1eQ9JMK2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms