Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx6Q9JKK1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx6Q9JKK1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms