Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp29Q9ES63 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp29Q9ES63 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms