Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcr6Q9EQ16 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcr6Q9EQ16 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms