Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp27a1Q9DBG1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp27a1Q9DBG1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp27a1Q9DBG1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms