Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubb4aQ9D6F9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tubb4aQ9D6F9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb4aQ9D6F9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms