Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Odf2lQ9D478 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Odf2lQ9D478 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Odf2lQ9D478 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Odf2lQ9D478 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Odf2lQ9D478 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Odf2lQ9D478 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Odf2lQ9D478 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Odf2lQ9D478 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Odf2lQ9D478 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Odf2lQ9D478 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Odf2lQ9D478 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Odf2lQ9D478 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Odf2lQ9D478 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Odf2lQ9D478 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Odf2lQ9D478 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Odf2lQ9D478 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Odf2lQ9D478 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Odf2lQ9D478 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Odf2lQ9D478 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Odf2lQ9D478 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Odf2lQ9D478 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Odf2lQ9D478 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Odf2lQ9D478 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Odf2lQ9D478 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Odf2lQ9D478 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Odf2lQ9D478 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Odf2lQ9D478 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Odf2lQ9D478 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Odf2lQ9D478 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Odf2lQ9D478 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Odf2lQ9D478 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Odf2lQ9D478 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Odf2lQ9D478 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Odf2lQ9D478 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Odf2lQ9D478 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Odf2lQ9D478 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Odf2lQ9D478 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Odf2lQ9D478 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Odf2lQ9D478 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Odf2lQ9D478 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Odf2lQ9D478 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Odf2lQ9D478 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Odf2lQ9D478 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Odf2lQ9D478 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Odf2lQ9D478 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Odf2lQ9D478 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Odf2lQ9D478 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Odf2lQ9D478 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms