Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F8

Toporsl, Topoisomerase I-binding, arginine/serine-rich-like, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ToporslQ9D2F8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ToporslQ9D2F8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ToporslQ9D2F8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ToporslQ9D2F8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ToporslQ9D2F8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ToporslQ9D2F8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ToporslQ9D2F8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ToporslQ9D2F8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ToporslQ9D2F8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms