Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl11Q9CXW4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl11Q9CXW4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms