Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BccipQ9CWI3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms