Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lhfpl3Q9CTN8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhfpl3Q9CTN8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms