Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR36

Gkn1, Gastrokine-1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn1Q9CR36 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gkn1Q9CR36 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gkn1Q9CR36 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gkn1Q9CR36 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gkn1Q9CR36 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms