Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifitm3Q9CQW9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms