Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nudt21Q9CQF3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nudt21Q9CQF3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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