Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700129C05RikQ9CQ77 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700129C05RikQ9CQ77 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700129C05RikQ9CQ77 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700129C05RikQ9CQ77 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700129C05RikQ9CQ77 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700129C05RikQ9CQ77 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700129C05RikQ9CQ77 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700129C05RikQ9CQ77 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700129C05RikQ9CQ77 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
1700129C05RikQ9CQ77 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700129C05RikQ9CQ77 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms