Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp3Q9CQ10 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chmp3Q9CQ10 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
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