Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NsmfQ99NF2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NsmfQ99NF2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NsmfQ99NF2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms