Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pramel1Q99MW3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramel1Q99MW3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramel1Q99MW3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramel1Q99MW3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramel1Q99MW3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramel1Q99MW3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramel1Q99MW3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pramel1Q99MW3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms