Protein–RNA interactions for Protein: Q925H1

Trps1, Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1Q925H1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trps1Q925H1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Trps1Q925H1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trps1Q925H1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trps1Q925H1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trps1Q925H1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trps1Q925H1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trps1Q925H1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trps1Q925H1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trps1Q925H1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trps1Q925H1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trps1Q925H1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trps1Q925H1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trps1Q925H1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trps1Q925H1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trps1Q925H1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trps1Q925H1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms