Protein–RNA interactions for Protein: Q923K4

Gtpbp3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp3Q923K4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtpbp3Q923K4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtpbp3Q923K4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtpbp3Q923K4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtpbp3Q923K4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtpbp3Q923K4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtpbp3Q923K4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtpbp3Q923K4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtpbp3Q923K4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtpbp3Q923K4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtpbp3Q923K4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtpbp3Q923K4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtpbp3Q923K4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtpbp3Q923K4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtpbp3Q923K4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtpbp3Q923K4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtpbp3Q923K4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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Gtpbp3Q923K4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtpbp3Q923K4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtpbp3Q923K4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtpbp3Q923K4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtpbp3Q923K4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtpbp3Q923K4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtpbp3Q923K4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtpbp3Q923K4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtpbp3Q923K4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtpbp3Q923K4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtpbp3Q923K4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtpbp3Q923K4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtpbp3Q923K4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtpbp3Q923K4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtpbp3Q923K4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtpbp3Q923K4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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Gtpbp3Q923K4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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Gtpbp3Q923K4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Gtpbp3Q923K4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Gtpbp3Q923K4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Gtpbp3Q923K4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Gtpbp3Q923K4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp3Q923K4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtpbp3Q923K4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtpbp3Q923K4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtpbp3Q923K4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtpbp3Q923K4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtpbp3Q923K4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtpbp3Q923K4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp3Q923K4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp3Q923K4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp3Q923K4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp3Q923K4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp3Q923K4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms